Проведение ЭКО на разных этапах требует использование определенных лекарственных средств. На начальной стадии необходимо подготовить женский организм к предстоящей стимуляции овуляции, на второй стадии препараты применяются для ускорения созревания и роста яйцеклеток. Третья и заключительная стадия ЭКО с переносом эмбриона в полость матки может потребовать использования медикаментозной терапии для поддержания нормального состояния слизистой оболочки матки, тем самым увеличивая процент успешности всей процедуры.

На начальной стадии назначаются препараты для подготовки яичников к стимуляции овуляции: антагонисты гонадолиберина (а-ГРГ). К примеру, действие препаратов Декапетил или Диферелин предупреждает начало овуляции раньше срока, чтобы фолликулы не лопались до проведения пункции. Лекарства ежедневно вводятся подкожными инъекциями, либо как депо-форма.

Антагонисты гонадолиберина также используются на завершающей стадии стимуляции для предотвращения ранней овуляции, например, Цетротид или Огралутран. Эти препараты вводятся внутримышечно не более 4-5 инъекций.

На второй стадии ЭКО используются лекарства гонадотропных гормонов: Гонал, Меногон, Элонва, Пурегон или Фостимон. Эти препараты регулируют процесс созревания фолликула путем обогащения организма гормонами гипофиза и лютеинизирующим гормоном. Назначаются подкожно или внутримышечно.

Хорионический гонадотропин (Профази или Прегнил) применяется для положительного окончания процесса формирования яйцеклеток. ХГЧ вводится в организм путем внутриматочных или подкожных инъекций.

Перед завершающей стадией ЭКО (переносом эмбриона в полость матки) назначаются препараты прогестерона. Дюфастон, Утрожестан, Инжеста, Лютеина и Пролютекс оказывают положительное влияние со слизистую матки, тем самым делая ее максимально благоприятной для закрепления эмбриона. Данные препараты используются и после переноса эмбриона, пока не сформируется плацента, которая должна выделять необходимый прогестерон.

Препараты с гормоном эстрадиолом (Прогинова) также часто применяются для положительного воздействия на слизистую матки. Обычно Прогинову в таблетках назначают пить до первого положительного теста на беременность.